摘要：為探究海水養(yǎng)殖石首魚類腸道菌群的結(jié)構(gòu)特征及宿主遺傳因素對腸道菌群的影響，實驗采用基于Illumina Hiseq2500測序平臺的高通量測序技術(shù)，對福建寧德三都澳養(yǎng)殖的5種石首魚類(大黃魚、黃姑魚、狀黃姑魚、和眼斑擬石首魚)的腸道菌群進(jìn)行16S rDNA V3～V4區(qū)測序分析。各樣本得到unique tags的數(shù)目為20 351～43 347個，上述5種魚類分別得到479、626、603、518和556個操作分類單元(OTUs)，分類注釋結(jié)果顯示，這些OTUs可劃歸33門273屬。5種石首魚類腸道內(nèi)容物和腸道壁樣品均以變形菌門、擬桿菌門和厚壁菌門細(xì)菌為主要優(yōu)勢菌群，約占總菌量的70%，在大黃魚腸道菌群中，螺旋菌門細(xì)菌占比達(dá)26.19%，也是其主要優(yōu)勢菌群。在屬分類水平上，芽孢桿菌屬、發(fā)光桿菌屬、弧菌屬、金黃桿菌屬、鞘氨醇單胞菌屬及假單胞菌屬等屬細(xì)菌是5種養(yǎng)殖石首魚類的主要類別。腸道菌群多樣性的分析表明，Shannon多樣性指數(shù)：黃姑魚>狀黃姑魚>眼斑擬石首魚>>大黃魚，這些養(yǎng)殖石首魚類的腸道內(nèi)容物菌群的多樣性均高于腸道壁。對上述魚類種間的腸道菌群差異性分析顯示，大黃魚與眼斑擬石首魚之間腸道菌群的相似度要高于黃姑魚、狀黃姑魚和，而黃姑魚、狀黃姑魚和間的相似度較高。研究表明，5種海水養(yǎng)殖石首魚類腸道菌群中存在自身特色的核心菌群，腸道菌群結(jié)構(gòu)的差異與種類間的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系相似，說明腸道菌群結(jié)構(gòu)與宿主遺傳因素密切相關(guān)。本研究可為養(yǎng)殖石首魚類飼料及益生制劑的開發(fā)、病害的防控等提供科學(xué)依據(jù)，并為宿主遺傳因素對魚類腸道菌群影響的研究提供相關(guān)實驗證據(jù)。
