摘要：近年來，人類活動影響導致水生態(tài)系統(tǒng)平衡遭到破壞，水生生物多樣性銳減，水生態(tài)健康狀況堪憂?？焖?、有效地監(jiān)測水生生物是評價水生態(tài)健康，科學開展水生態(tài)環(huán)境保護和管理的前提。環(huán)境DNA(environmental DNA,eDNA)技術是一種運用分子生物學方法，從環(huán)境樣品中提取DNA并進行測序和分析來反映物種信息的技術。由于該技術只需采集環(huán)境樣品(水、土壤、沉積物等)便能獲得大量物種信息，具有非入侵性、靈敏性及低成本等特點，近年來備受關注。但是，已有的研究實踐表明，目前eDNA技術仍然面臨一些挑戰(zhàn)，阻礙了其常態(tài)化、業(yè)務化應用。從生物多樣性調查、入侵和瀕危物種監(jiān)測、食性研究等方面列舉了eDNA技術在水生生物監(jiān)測中的應用實例，并總結目前eDNA技術在采樣效率、假陽性和假陰性、來源不確定性、數(shù)據(jù)庫缺失和定量結果不準確等5個方面所面臨的問題和挑戰(zhàn)；進一步探討研究者針對這些問題所提出的相應解決方案和技術突破。最后，對eDNA技術未來的發(fā)展前景進行了展望，以期為研究人員使用eDNA技術提供啟發(fā)。
