摘要：為了解凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)可能的微生物致病原因，通過對養(yǎng)殖水體環(huán)境細(xì)菌16S rRNA基因進(jìn)行高通量測序和生物信息學(xué)分析，研究比較了健康蝦塘(HSP)、少量死蝦塘(MinUH)和大量死蝦塘(MajUH)水體細(xì)菌群落組成。結(jié)果表明，MajUH氨氮、亞硝酸鹽、細(xì)菌總數(shù)均顯著高于其他組(P<0.05),HSP細(xì)菌群落香農(nóng)指數(shù)顯著高于MajUH(P<0.05)。養(yǎng)殖水體中優(yōu)勢菌門為變形菌門、藍(lán)藻門、放線菌門、擬桿菌門、綠菌門，其豐度在3類蝦塘中有很大差異，其中，藍(lán)藻門在HSP、MinUH、MajUH的豐度分別為6.17%、5.94%、46.85%。對蝦的大量死亡伴隨著細(xì)菌群落的變化，RDA分析表明，細(xì)菌群落的分布主要由亞硝酸鹽氮和氧化還原電位決定。通過文獻(xiàn)檢索和方差分析對HSP與MajUH進(jìn)行比較后發(fā)現(xiàn)，當(dāng)微生物群落多樣性下降時(shí)，其對高pH的抑制和調(diào)控作用將會減弱，從而影響對蝦健康狀況。此外，研究還確定了24個(gè)可區(qū)分健康和大量死亡蝦塘主要細(xì)菌指示物，明確了水體細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)作為蝦類健康狀態(tài)指示指標(biāo)的可行性。研究結(jié)果可為凡納濱對蝦養(yǎng)殖過程中的病害防治及新微生物資源開發(fā)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
