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正信專 共創(chuàng)美好生活
07-272023
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斑點叉尾腸道及其養(yǎng)殖環(huán)境菌群結構分析
摘要:為探究健康斑點叉尾(魚回)腸道及其與養(yǎng)殖池塘水體中菌群結構的關系,采用16S rDNA高通量測序方法和生物信息學分析手段考察其腸道和養(yǎng)殖水體中微生物群落組成和多樣性。多樣性指數(shù)分析結果表明,斑點叉尾(魚回)腸道菌群豐度和菌群多樣性均較養(yǎng)殖水體低。斑點叉尾(魚回)腸道中有69.57%的運算分類單元與水體中一致,水體中優(yōu)勢菌群主要為變形菌門、放線菌門和藍藻門,而腸道中的優(yōu)勢菌群為擬桿菌門、梭桿菌門和厚壁菌門,說明腸道和養(yǎng)殖水體中的優(yōu)勢微生物種群的組成和豐度無明顯的相關性,腸道中菌群組成有一定的獨立性,其優(yōu)勢菌群結構幾乎不受養(yǎng)殖環(huán)境菌群的影響。PICRUSt預測細菌表型發(fā)現(xiàn),斑點叉尾(魚回)腸道中以厭氧菌和革蘭氏陽性菌為主;從生物膜形成和致病潛力表型可知,腸道和水環(huán)境中均存在大量條件致病菌。試驗結果表明,池塘養(yǎng)殖健康斑點叉尾(魚回)腸道微生物中的優(yōu)勢益生菌主要為鯨桿菌屬和擬桿菌屬,平均相對豐度高達36.60%和15.82%。本試驗將為斑點叉尾(魚回)的健康養(yǎng)殖和益生菌的篩選提供理論依據(jù)。


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