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08-222024
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藥敏試驗與比較基因組揭示嗜水氣單胞菌耐藥潛力
摘要:為了揭示嗜水氣單胞菌的耐藥潛力,運用微量肉湯稀釋法和比較基因組學方法對其進行了分析。結(jié)果顯示:恩諾沙星、硫酸新霉素、氟苯尼考、鹽酸多西環(huán)素對3株菌株有抑制作用,而磺胺間甲氧嘧啶對3株菌株均無抑制作用。菌株的耐藥表型未與耐藥基因一一對應,某些菌株雖然未注釋到耐藥基因,也可以表現(xiàn)出相關(guān)耐藥表型;自測的3株菌株基因組大小差異較大,親緣關(guān)系非近緣,但耐藥基因數(shù)量基本一致;經(jīng)ANI(平均核苷酸一致性)計算后,基因組比較分析發(fā)現(xiàn)嗜水氣單胞菌基因組具有較強的可變性,即使是近緣菌株,其基因組間仍有較大差異;系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,不同宿主來源的菌株在進化樹上呈現(xiàn)分散分布,近緣菌株分布在不同國家和地區(qū);所有菌株在CARD(綜合抗生素耐藥性數(shù)據(jù)庫)中共注釋到21種耐藥基因,其中7種耐藥基因為所有菌株共享。造成這一現(xiàn)象的原因,很可能是由于嗜水氣單胞菌基因組較強的可變性以及其宿主分布的廣泛性,菌株間進行頻繁的基因交流,促進了耐藥基因在整個物種的快速擴散,所以即使菌株間基因組變化較大,但耐藥基因在菌株間的變化較小。


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